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本发明公开一种用密齿苦草演替穗花狐尾藻的植物种植配置方法,根据水域情况确定种植面积,采用扦插的方法种植穗花狐尾藻,一年后,待所述穗花狐尾藻种群建立良好后,按照密齿苦草:穗花狐尾藻=1∶1~3∶1的种植面积比例,采用扦插的方法在所述穗花狐尾藻的外缘种植所述密齿苦草,使其在自然生长过程中逐步演替所述穗花狐尾藻,直至其覆盖率达到80~85%。本发明巧妙利用密齿苦草和穗花狐尾藻的种群竞争关系,合理配置二者的种植比例和种植参数,有效地解决穗花狐尾藻在净化水体时后期易泛滥的技术难题,可产生协同高效水体净化和水生态修复效应,实现水生态系统的健康动态平衡。