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本发明公开了一种耐热多功能糖苷水解酶及其编码基因和应用,该基因核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示,氨基酸序列如SEQ IDNO.2所示。具有以下性质:多功能糖苷水解酶以羧甲基纤维素钠为底物测定纤维素酶活时,最适温度为70°C、最适pH为5;以魔芋甘露聚糖为底物测定甘露聚糖酶活时,最适温度为85°C、最适pH为6.5;多功能糖苷水解酶GH5在pH4.5‑7之间具有较好的稳定性。本发明的多功能糖苷水解酶具有多种酶活性且稳定性好,在能源、饲料和食品等行业中具有很好的应用前景。